核酸是由許多核苷酸聚合成的生物大分子化合物,為生命的最基本物質(zhì)之一。核酸廣泛存在于所有動(dòng)植物細(xì)胞、微生物體內(nèi),生物體內(nèi)的核酸常與蛋白質(zhì)結(jié)合形成核蛋白。
不同的核酸,其化學(xué)組成、核苷酸排列順序等不同。根據(jù)化學(xué)組成不同,核酸可分為核糖核酸(簡(jiǎn)稱(chēng)RNA)和脫氧核糖核酸(簡(jiǎn)稱(chēng)DNA)。DNA是儲(chǔ)存、復(fù)制和傳遞遺傳信息的主要物質(zhì)基礎(chǔ)。RNA在蛋白質(zhì)合成過(guò)程中起著重要作用--其中轉(zhuǎn)運(yùn)核糖核酸,簡(jiǎn)稱(chēng)tRNA,起著攜帶和轉(zhuǎn)移活化氨基酸的作用;信使核糖核酸,簡(jiǎn)稱(chēng)mRNA,是合成蛋白質(zhì)的模板;核糖體的核糖核酸,簡(jiǎn)稱(chēng)rRNA,是細(xì)胞合成蛋白質(zhì)的主要場(chǎng)所。
中文名稱(chēng) | 核酸 | 外文名稱(chēng) | nucleic acid |
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拼音 | hé suān | 分類(lèi) | 核糖核酸、脫氧核糖核酸 |
分子量 | 一般是幾十萬(wàn)至幾百萬(wàn) | CAS登錄號(hào) | 63231-63-0 |
EINECS登錄號(hào) | 277-256-77 |
核酸(nucleic acid)是重要的生物大分子,它的構(gòu)件分子是核苷酸(nucleotide)。
天然存在的核酸可分為:
⑴脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)和核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)
DNA貯存細(xì)胞所有的遺傳信息,是物種保持進(jìn)化和世代繁衍的物質(zhì)基礎(chǔ)。
RNA中參與蛋白質(zhì)合成的有三類(lèi):
轉(zhuǎn)移RNA(transfer RNA,tRNA)、核糖體RNA(ribosomal RNA,rRNA)和信使RNA(messenger RNA,mRNA)
20世紀(jì)末,發(fā)現(xiàn)許多新的具有特殊功能的RNA,幾乎涉及細(xì)胞功能的各個(gè)方面。
核苷酸可分為:核糖核苷酸(RNA的構(gòu)件分子)和 脫氧核糖核苷酸(DNA構(gòu)件分子)
細(xì)胞內(nèi)還有各種游離的核苷酸和核苷酸衍生物,它們具有重要的生理功能。
核苷酸由 核苷(nucleoside)磷酸(Phosphonic.acid)組成
核苷由:堿基(base)和 戊糖(Pentose)組成
構(gòu)成核苷酸中的堿基是含氮雜環(huán)化合物,由嘧啶(pyrimidine)和嘌呤(purine)構(gòu)成。
核酸:1.嘌呤堿:腺嘌呤(A)鳥(niǎo)嘌呤(G)2.嘧啶堿: 胞嘧啶(C)胸腺嘧啶(T) 尿嘧啶(U)
DNA中含有4種堿基:腺嘌呤、鳥(niǎo)嘌呤和胞嘧啶,胸腺嘧啶主要存在于DNA中。
RNA中含也有4種堿基:腺嘌呤、鳥(niǎo)嘌呤和胞嘧啶,尿嘧啶主要存在于RNA中。
在某些tRNA分子中也有胸腺嘧啶,少數(shù)幾種噬菌體的DNA含尿嘧啶而不是胸腺嘧啶。這五種堿基受介質(zhì)pH的影響出現(xiàn)酮式、烯醇式互變異構(gòu)體。
在DNA和RNA中,尤其是tRNA中還有一些含量甚少的堿基,稱(chēng)為稀有堿基(rare bases)稀有堿基種類(lèi)很多,大多數(shù)是甲基化堿基。tRNA中含稀有堿基高達(dá)10%。
核酸中有兩種戊糖DNA中為D-2-脫氧核糖(D-2-deoxyribose),RNA中則為D-核糖(D-ribose)。在核苷酸中,為了與堿基中的碳原子編號(hào)相區(qū)別核糖或脫氧核糖中碳原子標(biāo)以C-1',C-2'等。脫氧核糖與核糖兩者的差別只在于脫氧核糖中與2'位碳原子連結(jié)的不是羥基而是氫,這一差別使DNA在化學(xué)上比RNA穩(wěn)定得多。
核苷是戊糖與堿基之間以糖苷鍵(glycosidic bond)相連接而成。戊糖中C-1'與嘧啶堿的N-1或者與嘌吟堿的N9相連接,戊糖與堿基間的連接鍵是N-C鍵,一般稱(chēng)為N-糖苷鍵。
RNA中含有稀有堿基,并且還存在異構(gòu)化的核苷。如在tRNA和rRNA中含有少量假尿嘧啶核苷(用ψ表示),在它的結(jié)構(gòu)中戊糖的C-1不是與尿嘧啶的N-1相連接,而是與尿嘧啶C-5相連接。
核苷中的戊糖5'碳原子上羥基被磷酸酯化形成核苷酸。核苷酸分為核糖核苷酸與脫氧核糖核苷酸兩大類(lèi)。依磷酸基團(tuán)的多少,有一磷酸核苷、二磷酸核苷、三磷酸核苷。核苷酸在體內(nèi)除構(gòu)成核酸外,尚有一些游離核苷酸參與物質(zhì)代謝、能量代謝與代謝調(diào)節(jié),如三磷酸腺苷(ATP)是體內(nèi)重要能量載體;三磷酸尿苷參與糖原的合成;三磷酸胞苷參與磷脂的合成;環(huán)腺苷酸(cAMP)和環(huán)鳥(niǎo)苷酸(cGMP)作為第二信使,在信號(hào)傳遞過(guò)程中起重要作用;核苷酸還參與某些生物活性物質(zhì)的組成:如尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+),尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP+)和黃素腺嘌呤二核苷酸(FAD)。
核酸分子結(jié)構(gòu)
核酸是由核苷酸聚合而成的生物大分子。組成DNA的脫氧核糖核苷酸主要是dAMP、dGMP、dCMP和dTMP,組成RNA的核糖核苷酸主要是AMP、GMP、CMP和UMP。核酸中的核苷酸以3',5'磷酸二酯鍵構(gòu)成無(wú)分支結(jié)構(gòu)的線(xiàn)性分子。核酸鏈具有方向性,有兩個(gè)末端分別是5'末端與3'末端。5'末端含磷酸基團(tuán),3'末端含羥基。核酸鏈內(nèi)的前一個(gè)核苷酸的3'羥基和下一個(gè)核苷酸的5'磷酸形成3',5'磷酸二酯鍵,故核酸中的核苷酸被稱(chēng)為核苷酸殘基。通常將小于50個(gè)核苷酸殘基組成的核酸稱(chēng)為寡核苷酸(oligonucleotide),大于50個(gè)核苷酸殘基稱(chēng)為多核苷酸(polynucleotide)。
(一)DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)
DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)即雙螺旋結(jié)構(gòu)(double helix structure)。20世紀(jì)50年代初Chargaff等人分析多種生物DNA的堿基組成發(fā)現(xiàn)的規(guī)則。
DNA雙螺旋模型的提出不僅揭示了遺傳信息穩(wěn)定傳遞中DNA半保留復(fù)制的機(jī)制,而且是分子生物學(xué)發(fā)展的里程碑。
DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)特點(diǎn)如下:①兩條DNA互補(bǔ)鏈反向平行。②由脫氧核糖和磷酸間隔相連而成的親水骨架在螺旋分子的外側(cè),而疏水的堿基對(duì)則在螺旋分子內(nèi)部,堿基平面與螺旋軸垂直,螺旋旋轉(zhuǎn)一周正好為10個(gè)堿基對(duì),螺距為3.4nm,這樣相鄰堿基平面間隔為0.34nm并有一個(gè)36°的夾角。③DNA雙螺旋的表面存在一個(gè)大溝(major groove)和一個(gè)小溝(minor groove),蛋白質(zhì)分子通過(guò)這兩個(gè)溝與堿基相識(shí)別。④兩條DNA鏈依靠彼此堿基之間形成的氫鍵而結(jié)合在一起。根據(jù)堿基結(jié)構(gòu)特征,只能形成嘌呤與嘧啶配對(duì),即A與T相配對(duì),形成2個(gè)氫鍵;G與C相配對(duì),形成3個(gè)氫鍵。因此G與C之間的連接較為穩(wěn)定。⑤DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)比較穩(wěn)定。維持這種穩(wěn)定性主要靠堿基對(duì)之間的氫鍵以及堿基的堆集力(stacking force)。
生理?xiàng)l件下,DNA雙螺旋大多以B型形式存在。右手雙螺旋DNA除B型外還有A型、C型、D型、E型。此外還發(fā)現(xiàn)左手雙螺旋Z型DNA。Z型DNA是1979年Rich等在研究人工合成的CGCGCG的晶體結(jié)構(gòu)時(shí)發(fā)現(xiàn)的。Z-DNA的特點(diǎn)是兩條反向平行的多核苷酸互補(bǔ)鏈組成的螺旋呈鋸齒形,其表面只有一條深溝,每旋轉(zhuǎn)一周是12個(gè)堿基對(duì)。研究表明在生物體內(nèi)的DNA分子中確實(shí)存在Z-DNA區(qū)域,其功能可能與基因表達(dá)的調(diào)控有關(guān)。DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)還存在三股螺旋DNA,三股螺旋DNA中通常是一條同型寡核苷酸與寡嘧啶核苷酸-寡嘌呤核苷酸雙螺旋的大溝結(jié)合,三股螺旋中的第三股可以來(lái)自分子間,也可以來(lái)自分子內(nèi)。三股螺旋DNA存在于基因調(diào)控區(qū)和其他重要區(qū)域,因此具有重要生理意義。
(二)DNA三級(jí)結(jié)構(gòu)--超螺旋結(jié)構(gòu)
DNA三級(jí)結(jié)構(gòu)是指DNA鏈進(jìn)一步扭曲盤(pán)旋形成超螺旋結(jié)構(gòu)。生物體內(nèi)有些DNA是以雙鏈環(huán)狀DNA形式存在,如有些病毒DNA,某些噬菌體DNA,細(xì)菌染色體與細(xì)菌中質(zhì)粒DNA,真核細(xì)胞中的線(xiàn)粒體DNA、葉綠體DNA都是環(huán)狀的。環(huán)狀DNA分子可以是共價(jià)閉合環(huán),即環(huán)上沒(méi)有缺口,也可以是缺口環(huán),環(huán)上有一個(gè)或多個(gè)缺口。在DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上,共價(jià)閉合環(huán)DNA(covalently close circular DNA)可以進(jìn)一步扭曲形成超螺旋形(super helical form)。根據(jù)螺旋的方向可分為正超螺旋和負(fù)超螺旋。正超螺旋使雙螺旋結(jié)構(gòu)更緊密,雙螺旋圈數(shù)增加,而負(fù)超螺旋可以減少雙螺旋的圈數(shù)。幾乎所有天然DNA中都存在負(fù)超螺旋結(jié)構(gòu)。
(三)DNA的四級(jí)結(jié)構(gòu)--DNA與蛋白質(zhì)形成復(fù)合物
在真核生物中其基因組DNA要比原核生物大得多,如原核生物大腸桿菌的DNA約為4.7×10kb,而人的基因組DNA約為3×10 kb,因此真核生物基因組DNA通常與蛋白質(zhì)結(jié)合,經(jīng)過(guò)多層次反復(fù)折疊,壓縮近10 000倍后,以染色體形式存在于平均直徑為5μm的細(xì)胞核中。線(xiàn)性雙螺旋DNA折疊的第一層次是形成核小體(nucleosome)。猶如一串念珠,核小體由直徑為11nm×5.5nm的組蛋白核心和盤(pán)繞在核心上的DNA構(gòu)成。核心由組蛋白H2A、H2B、H3和H4各2分子組成,為八聚體,146 bp長(zhǎng)的DNA以左手螺旋盤(pán)繞在組蛋白的核心1.75圈,形成核小體的核心顆粒,各核心顆粒間有一個(gè)連接區(qū),約有60 bp雙螺旋DNA和1個(gè)分子組蛋白H1構(gòu)成。平均每個(gè)核小體重復(fù)單位約占DNA 200 bp。DNA組裝成核小體其長(zhǎng)度約縮短7倍。在此基礎(chǔ)上核小體又進(jìn)一步盤(pán)繞折疊,最后形成染色體。
(四)DNA結(jié)構(gòu)的多態(tài)性
Watson和Crick所推導(dǎo)出來(lái)的DNA結(jié)構(gòu)在生物學(xué)研究中有深遠(yuǎn)意義。他們是以在生理鹽溶液中抽出的DNA纖維在92%相對(duì)溫度下進(jìn)行X-射線(xiàn)衍射圖譜為依據(jù)進(jìn)行推設(shè)的。在這一條件下得出的DNA稱(chēng)B構(gòu)象。實(shí)際上在溶液中的DNA的確呈這一構(gòu)象,這也是最常見(jiàn)的DNA構(gòu)象。但是,研究表明DNA的結(jié)構(gòu)是動(dòng)態(tài)的。在以鈉、鉀或銫作反離子,相對(duì)溫度為75%時(shí),DNA分子的X-射線(xiàn)衍射圖給出的是A構(gòu)象。這一構(gòu)象不僅出現(xiàn)于脫水DNA中,還出現(xiàn)在RNA分子中的雙螺旋區(qū)域的DNA-RNA雜交分子中。如果以鋰作反離子,相對(duì)溫度進(jìn)一步降為66%,則DNA是C構(gòu)象。但是這一構(gòu)象僅在實(shí)驗(yàn)室中觀(guān)察到,還未在生物體中發(fā)現(xiàn)。這些DNA分子中G-C堿基對(duì)較少,這些分子將取D和E構(gòu)象。這些研究表明DNA的分子結(jié)構(gòu)不是一成不變的,在不同的條件下可以有所不同。但是,這些不同構(gòu)象的DNA都有共同的一點(diǎn),即它們都是右手雙螺旋;兩條反向平行的核苷酸鏈通過(guò)Watson-Crick堿基配對(duì)結(jié)合在一起;鏈的重復(fù)單位是單核苷酸;這些螺旋中都有兩個(gè)螺旋溝,分為大溝與小溝,只是它們的寬窄和深淺程度有所不同。
但是,Wang和Rich等人在研究人工合成的CGCGCG單晶的X-射線(xiàn)衍射圖譜時(shí)分別發(fā)現(xiàn)這種六聚體的構(gòu)象與上面講到的完全不同。它是左手雙螺旋,在主鏈中各個(gè)磷酸根呈鋸齒狀排列,有如"之"字形一樣,因此叫它Z構(gòu)象(英文字Zigzag的第一個(gè)字母)。還有,這一構(gòu)象中的重復(fù)單位是二核苷酸而不是單核苷酸;而且Z-DNA只有一個(gè)螺旋溝,它相當(dāng)于B構(gòu)象中的小溝,它狹而深,大溝則不復(fù)存在。
立即就有幾個(gè)問(wèn)題被提了出來(lái):這種結(jié)構(gòu)是怎樣生成的?這一結(jié)構(gòu)在天然狀態(tài)下存在嗎?它有什么生物學(xué)意義?
研究表明,Z-DNA的形成是DNA單鏈上出現(xiàn)嘌呤與嘧啶交替排列所成的。比如CGCGCGCG或者CACACACA。這種堿基排列方式會(huì)造成核苷酸的糖苷鍵的順式和反式構(gòu)象的交替存在。當(dāng)堿基與糖構(gòu)成反式結(jié)構(gòu)時(shí),它們之間離得遠(yuǎn);而當(dāng)它們成順式時(shí),就彼此接近。嘧啶糖苷鍵通常是反式的,而嘌呤糖苷酸鍵既可成順式的也可成反式的。而在Z-DNA中,嘌呤堿是順式的。這樣,在Z-DNA中嘧啶的糖苷鏈離開(kāi)小溝向外挑出,而嘌呤上的糖苷鍵則彎向小溝。嘌呤與嘧啶的交替排列就使得糖苷鍵也是順式與反式交替排列,從而使Z-DNA主鏈呈鋸齒狀或"之"字形。
人們相信,并用實(shí)驗(yàn)證明細(xì)胞DNA分子中確實(shí)存在有Z-DNA區(qū)。而且,細(xì)胞內(nèi)有一些因素可以促使B-DNA轉(zhuǎn)變?yōu)閆-DNA。比如,胞嘧啶第五位碳原子的甲基化,在甲基周?chē)纬删植康氖杷畢^(qū)。這一區(qū)域擴(kuò)伸到B-DNA的大溝中,使B-DNA不穩(wěn)定而轉(zhuǎn)變?yōu)閆-DNA。這種C5甲基化現(xiàn)象在真核生物中是常見(jiàn)的。因此在生物B構(gòu)象的DNA中某些區(qū)段具有Z-DNA構(gòu)象是可能的。DNA真是一個(gè)構(gòu)象可變動(dòng)態(tài)分子。
Z-DNA有會(huì)么生物學(xué)意義呢?應(yīng)當(dāng)指出Z-DNA的形成通常在熱力學(xué)上是不利的。因?yàn)閆-DNA中帶負(fù)電荷的磷酸根距離太近了,這會(huì)產(chǎn)物靜電排斥。但是,DNA鏈的局部不穩(wěn)定區(qū)的存在就成為潛在的解鏈位點(diǎn)。DNA解螺旋卻是DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄等過(guò)程中必要的環(huán)節(jié),因此認(rèn)為這一結(jié)構(gòu)位點(diǎn)與基因調(diào)節(jié)有關(guān)。比如SV40增強(qiáng)子區(qū)中就有這種結(jié)構(gòu),又如鼠類(lèi)微小病毒DNS復(fù)制區(qū)起始點(diǎn)附近有GC交替排列序列。此外,DNA螺旋上溝的特征在其信息表達(dá)過(guò)程中起關(guān)鍵作用。調(diào)控蛋白都是通過(guò)其分子上特定的氨基酸側(cè)鏈與DNA雙螺旋溝中的堿基對(duì)一側(cè)的氫原子供體或受體相互作用,形成氫鍵從而識(shí)別DNA上的遺傳信息的。大溝所帶的遺傳信息比小溝多。溝的寬窄和深淺也直接影響到調(diào)控蛋白質(zhì)對(duì)DNA信息的識(shí)別。Z-DNA中大溝消失,小溝狹而深,使調(diào)探蛋白識(shí)別方式也發(fā)生變化。這些都暗示Z-DNA的存在不僅僅是由于DNA中出現(xiàn)嘌呤-啶嘧交替排列之結(jié)果,也一定是在漫漫的進(jìn)化長(zhǎng)河中對(duì)DNA序列與結(jié)構(gòu)不斷調(diào)整與篩選的結(jié)果,有其內(nèi)在而深刻的含意,只是人們還未充分認(rèn)識(shí)而已。
DNA構(gòu)象的可變性,或者說(shuō)DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的多態(tài)性的發(fā)現(xiàn)拓寬了人們的視野。原來(lái),生物體中最為穩(wěn)定的遺傳物質(zhì)也可以采用不同的姿態(tài)來(lái)實(shí)現(xiàn)其豐富多彩的生物的奧妙,也讓人們?cè)谶@一領(lǐng)域中探索和攀越時(shí)減少疲勞和厭倦,樂(lè)而忘返,從而有更多更新的發(fā)現(xiàn)。
多年來(lái),DNA結(jié)構(gòu)的研究手段主要是X射線(xiàn)衍線(xiàn)技術(shù),其結(jié)果是通過(guò)間接觀(guān)測(cè)多個(gè)DNA分子有關(guān)結(jié)構(gòu)參數(shù)的平均值而獲得的。同時(shí),這項(xiàng)技術(shù)的樣品分析條件使被測(cè)DNA分子與天然狀態(tài)相差甚遠(yuǎn)。因此,在反映DNA結(jié)構(gòu)真實(shí)性方面這種方法存在著缺陷。1989年,應(yīng)用掃描隧道顯微鏡(STM)研究DNA結(jié)構(gòu)克服了上述技術(shù)的缺陷。這種先進(jìn)的顯微技術(shù),不僅可將被測(cè)物放大500萬(wàn)倍,且能直接觀(guān)測(cè)接近天然條件下單個(gè)DNA分子的結(jié)構(gòu)細(xì)節(jié)。應(yīng)該說(shuō)它所取得的DNA結(jié)構(gòu)資料更具有"權(quán)威性"。表1-6是STM測(cè)到的B-DNA結(jié)構(gòu)參數(shù)及其與X射線(xiàn)衍線(xiàn)資料的比較結(jié)果。STM研究還證實(shí)了d(CG)重復(fù)序列的寡核苷酸片段為Z-DNA結(jié)構(gòu)的事實(shí)。STM技術(shù)的應(yīng)用是DNA結(jié)構(gòu)研究中的重要進(jìn)展,可望在探索DNA結(jié)構(gòu)的某些未知點(diǎn)上展示巨大潛力。
(一)基因(gene)的現(xiàn)代分子生物學(xué)概念是指能編碼有功能的蛋白質(zhì)多肽鏈或合成RNA所必需的全部核酸序列,是核酸分子的功能單位。一個(gè)基因通常包括編碼蛋白質(zhì)多肽鏈或RNA的編碼序列,保證轉(zhuǎn)錄和加工所必需的調(diào)控序列和5'端、3'端非編碼序列。另外在真核生物基因中還有內(nèi)含子等核酸序列。
(二)基因組(genome)是指一個(gè)細(xì)胞或病毒所有基因及間隔序列,儲(chǔ)存了一個(gè)物種所有的遺傳信息。在病毒中通常是一個(gè)核酸分子的堿基序列,單細(xì)胞原核生物是它僅有的一條染色體的堿基序列,而多細(xì)胞真核生物是一個(gè)單倍體細(xì)胞內(nèi)所有的染色體。如人單倍體細(xì)胞的23條染色體的堿基序列。多細(xì)胞真核生物起源于同一個(gè)受精卵,其每個(gè)體細(xì)胞的基因組都是相同的。
病毒基因組原核生物基因組真核生物基因組在高等真核生物中基因序列占整個(gè)基因組不到10%,大部分是非編碼的間隔序列。人類(lèi)基因組研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)在人的基因組中與蛋白質(zhì)合成有關(guān)的基因只占整個(gè)基因組2 %。真核生物基因組的最大的特點(diǎn)是出現(xiàn)分隔開(kāi)的基因,在這類(lèi)基因中有編碼作用的序列稱(chēng)外顯子(exon),沒(méi)有編碼作用的序列稱(chēng)內(nèi)含子(intron),它們彼此間隔排列。
絕大部分RNA分子都是線(xiàn)狀單鏈,但是RNA分子的某些區(qū)域可自身回折進(jìn)行堿基互補(bǔ)配對(duì),形成局部雙螺旋。在RNA局部雙螺旋中A與U配對(duì)、G與C配對(duì),除此以外,還存在非標(biāo)準(zhǔn)配對(duì),如G與U配對(duì)。RNA分子中的雙螺旋與A型DNA雙螺旋相似,而非互補(bǔ)區(qū)則膨脹形成凸出(bulge)或者環(huán)(loop),這種短的雙螺旋區(qū)域和環(huán)稱(chēng)為發(fā)夾結(jié)構(gòu)(hairpin)。發(fā)夾結(jié)構(gòu)是RNA中最普通的二級(jí)結(jié)構(gòu)形式,二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)一步折疊形成三級(jí)結(jié)構(gòu),RNA只有在具有三級(jí)結(jié)構(gòu)時(shí)才能成為有活性的分子。RNA也能與蛋白質(zhì)形成核蛋白復(fù)合物,RNA的四級(jí)結(jié)構(gòu)是RNA與蛋白質(zhì)的相互作用。
(一) tRNA的結(jié)構(gòu)
tRNA約占總RNA的15%,tRNA主要的生理功能是在蛋白質(zhì)生物合成中轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸和識(shí)別密碼子,細(xì)胞內(nèi)每種氨基酸都有其相應(yīng)的一種或幾種tRNA,因此tRNA的種類(lèi)很多,在細(xì)菌中約有30~40種tRNA,在動(dòng)物和植物中約有50~100種tRNA。 1. tRNA一級(jí)結(jié)構(gòu):
tRNA是單鏈分子,含73~93核苷酸,分子質(zhì)量為24 000~31 000,沉降系數(shù)4S。含有10%的稀有堿基。如二氫尿嘧啶(DHU)、核糖胸腺嘧啶(rT)和假尿苷(ψ)以及不少堿基被甲基化,其3'端為CCA-OH,5'端多為pG,分子中大約30%的堿基是不變的或半不變的,也就是說(shuō)它們的堿基類(lèi)型是保守的。
2. tRNA二級(jí)結(jié)構(gòu): tRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)為三葉草型(如右圖)。配對(duì)堿基形成局部雙螺旋而構(gòu)成臂,不配對(duì)的單鏈部分則形成環(huán)。三葉草型結(jié)構(gòu)由4臂4環(huán)組成。氨基酸臂由7對(duì)堿基組成,雙螺旋區(qū)的3'末端為一個(gè)4個(gè)堿基的單鏈區(qū)-NCCA-OH 3',腺苷酸殘基的羥基可與氨基酸α羧基結(jié)合而攜帶氨基酸。二氫尿嘧啶環(huán)以含有2個(gè)稀有堿基二氫尿嘧啶(DHU)而得名,不同tRNA其大小并不恒定,在8~14個(gè)堿基之間變動(dòng),二氫尿嘧啶臂一般由3~4對(duì)堿基組成。反密碼環(huán)由7個(gè)堿基組成,大小相對(duì)恒定,其中3個(gè)核苷酸組成反密碼子(anticodon),在蛋白質(zhì)生物合成時(shí),可與mRNA上相應(yīng)的密碼子配對(duì)。反密碼臂由5對(duì)堿基組成。額外環(huán)在不同tRNA分子中變化較大可在4~21個(gè)堿基之間變動(dòng),又稱(chēng)為可變環(huán),其大小往往是tRNA分類(lèi)的重要指標(biāo)。TψC環(huán)含有7個(gè)堿基,大小相對(duì)恒定,幾乎所有的tRNA在此環(huán)中都含TψC序列,TψC臂由5對(duì)堿基組成。
3. tRNA的三級(jí)結(jié)構(gòu):
二十世紀(jì)七十年代初科學(xué)家用X線(xiàn)射衍技術(shù)分析發(fā)現(xiàn)tRNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)為倒L形(如右圖)。tRNA三級(jí)結(jié)構(gòu)的特點(diǎn)是氨基酸臂與TψC臂構(gòu)成L的一橫,-CCAOH3'末端就在這一橫的端點(diǎn)上,是結(jié)合氨基酸的部位,而二氫尿嘧啶臂與反密碼臂及反密碼環(huán)共同構(gòu)成L的一豎,反密碼環(huán)在一豎的端點(diǎn)上,能與mRNA上對(duì)應(yīng)的密碼子識(shí)別,二氫尿嘧啶環(huán)與TψC環(huán)在L的拐角上。形成三級(jí)結(jié)構(gòu)的很多氫鍵與tRNA中不變的核苷酸密切有關(guān),這就使得各種tRNA三級(jí)結(jié)構(gòu)都呈倒L形的。在tRNA中堿基堆積力是穩(wěn)定tRNA構(gòu)型的主要因素。
(二)mRNA
原核生物中mRNA轉(zhuǎn)錄后一般不需加工,直接進(jìn)行蛋白質(zhì)翻譯。mRNA轉(zhuǎn)錄和翻譯不僅發(fā)生在同一細(xì)胞空間,而且這兩個(gè)過(guò)程幾乎是同時(shí)進(jìn)行的。真核細(xì)胞成熟mRNA是由其前體核內(nèi)不均一RNA(heterogeneous nuclear RNA,hnRNA)剪接并經(jīng)修飾后才能進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)中參與蛋白質(zhì)合成。所以真核細(xì)胞mRNA的合成和表達(dá)發(fā)生在不同的空間和時(shí)間。mRNA的結(jié)構(gòu)在原核生物中和真核生物中差別很大。下面分別作一介紹:
1. 原核生物mRNA結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
原核生物的mRNA結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,往往含有幾個(gè)功能上相關(guān)的蛋白質(zhì)的編碼序列,可翻譯出幾種蛋白質(zhì),為多順?lè)醋?。在原核生物mRNA中編碼序列之間有間隔序列,可能與核糖體的識(shí)別和結(jié)合有關(guān)。在5'端與3'端有與翻譯起始和終止有關(guān)的非編碼序列,原核生物mRNA中沒(méi)有修飾堿基,5'端沒(méi)有帽子結(jié)構(gòu),3'端沒(méi)有多聚腺苷酸的尾巴(polyadenylate tail,polyA尾巴)。原核生物的mRNA的半衰期比真核生物的要短得多,轉(zhuǎn)錄后1min,mRNA降解就開(kāi)始。
2. 真核生物mRNA結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
真核生物mRNA為單順?lè)醋咏Y(jié)構(gòu),即一個(gè)mRNA分子只包含一條多肽鏈的信息。在真核生物成熟的mRNA中5'端有m7GpppN的帽子結(jié)構(gòu),帽子結(jié)構(gòu)可保護(hù)mRNA不被核酸外切酶水解,并且能與帽結(jié)合蛋白結(jié)合識(shí)別核糖體并與之結(jié)合,與翻譯起始有關(guān)。3'端有polyA尾巴,其長(zhǎng)度為20~250個(gè)腺苷酸,其功能可能與mRNA的穩(wěn)定性有關(guān),少數(shù)成熟mRNA沒(méi)有polyA尾巴,如組蛋白mRNA,它們的半衰期通常較短。
(三)rRNA的結(jié)構(gòu)
rRNA占細(xì)胞總RNA的80%左右,rRNA分子為單鏈,局部有雙螺旋區(qū)域具有復(fù)雜的空間結(jié)構(gòu),原核生物主要的rRNA有三種,即5S、16S和23S rRNA,如大腸桿菌的這三種rRNA分別由120、1542和2904個(gè)核苷酸組成。真核生物則有4種,即5S、5.8S、18S和28S rRNA,如小鼠,它們相應(yīng)含121、158、1874和4718個(gè)核苷酸。rRNA分子作為骨架與多種核糖體蛋白(ribosomal protein)裝配成核糖體。
所有生物體的核糖體都由大小不同的兩個(gè)亞基所組成。原核生物核糖體為70S,由50S和30S兩個(gè)大小亞基組成。30S小亞基含16S的rRNA和21種蛋白質(zhì),50S大亞基含23S和5S兩種rRNA及34種蛋白質(zhì)。真核生物核糖體為80S,是由60S和40S兩個(gè)大小亞基組成。40S的小亞基含18S rRNA及33種蛋白質(zhì),60S大亞基則由28S、5.8S和5S 3種rRNA及49種蛋白質(zhì)組成。
(四)其他RNA分子
20世紀(jì)80年代以后由于新技術(shù)不斷產(chǎn)生,人們發(fā)現(xiàn)RNA有許多新的功能和新的RNA基因。細(xì)胞核內(nèi)小分子RNA(small nuclear RNA,snRNA)是細(xì)胞核內(nèi)核蛋白顆粒(Small nuclear ribonucleoprotein particles,snRNPs)的組成成分,參與mRNA前體的剪接以及成熟的mRNA由核內(nèi)向胞漿中轉(zhuǎn)運(yùn)的過(guò)程。核仁小分子RNA(small nucleolar RNA,snoRNA)是類(lèi)新的核酸調(diào)控分子, 參與rRNA前體的加工以及核糖體亞基的裝配。胞質(zhì)小分子RNA(small cytosol RNA, scRNA)的種類(lèi)很多,其中7S LRNA與蛋白質(zhì)一起組成信號(hào)識(shí)別顆粒(signal recognition particle,SRP),SRP參與分泌性蛋白質(zhì)的合成,反義RNA(antisense RNA)由于它們可以與特異的mRNA序列互補(bǔ)配對(duì),阻斷mRNA翻譯,能調(diào)節(jié)基因表達(dá)。核酶是具有催化活性的RNA分子或RNA片段。在醫(yī)學(xué)研究中已設(shè)計(jì)了針對(duì)病毒的致病基因mRNA的核酶,抑制其蛋白質(zhì)的生物合成,為基因治療開(kāi)辟新的途徑,核酶的發(fā)現(xiàn)也推動(dòng)了生物起源的研究。微RNA(microRNA,miRNA)是一種具有莖環(huán)結(jié)構(gòu)的非編碼RNA,長(zhǎng)度一般為20-24個(gè)核苷酸,在mRNA翻譯過(guò)程中起到開(kāi)關(guān)作用,它可以與靶mRNA結(jié)合,產(chǎn)生轉(zhuǎn)錄后基因沉默作用(post-transcriptional gene silencing,PTGS),在一定條件下能釋放,這樣mRNA又能翻譯蛋白質(zhì),由于miRNA的表達(dá)具有階段特異性和組織特異性,它們?cè)诨虮磉_(dá)調(diào)控和控制個(gè)體發(fā)育中起重要作用。
隨著基因組研究不斷深入,蛋白組學(xué)研究逐漸展開(kāi),RNA的研究也取得了突破性的進(jìn)展,發(fā)現(xiàn)了許多新的RNA分子,人們逐漸認(rèn)識(shí)到DNA是攜帶遺傳信息分子,蛋白質(zhì)是執(zhí)行生物學(xué)功能分子,而RNA即是信息分子,又是功能分子。人類(lèi)基因組研究結(jié)果表明,在人類(lèi)基因組中約有30000~40000個(gè)基因,其中與蛋白質(zhì)生物合成有關(guān)的基因只占整個(gè)基因組的2%,對(duì)不編碼蛋白質(zhì)的98%基因組的功能有待進(jìn)一步研究,為此20世紀(jì)末科學(xué)家在提出蛋白質(zhì)組學(xué)后,又提出RNA組學(xué)。RNA組是研究細(xì)胞的全部RNA基因和RNA的分子結(jié)構(gòu)與功能。
核酸同蛋白質(zhì)一樣,也是生物大分子。核酸的相對(duì)分子質(zhì)量很大,一般是幾十萬(wàn)至幾百萬(wàn)。核酸水解后得到許多核苷酸,實(shí)驗(yàn)證明,核苷酸是組成核酸的基本單位,即組成核酸分子的單體。一個(gè)核苷酸分子是由一分子含氮的堿基、一分子五碳糖和一分子磷酸組成的。根據(jù)五碳糖的不同可以將核苷酸分為脫氧核糖核苷酸和核糖核苷酸。
核酸大分子可分為兩類(lèi):脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA),在蛋白質(zhì)的復(fù)制和合成中起著儲(chǔ)存和傳遞遺傳信息的作用。核酸不僅是基本的遺傳物質(zhì),而且在蛋白質(zhì)的生物合成上也占重要位置,因而在生長(zhǎng)、遺傳、變異等一系列重大生命現(xiàn)象中起決定性的作用。
核酸 | DNA | RNA |
---|---|---|
名稱(chēng) | 脫氧核糖核酸 | 核糖核酸 |
結(jié)構(gòu) | 規(guī)則的雙螺旋結(jié)構(gòu) | 通常呈單鏈結(jié)構(gòu) |
基本單位 | 脫氧核糖核苷酸 | 核糖核苷酸 |
五碳糖 | 脫氧核糖 | 核糖 |
含氮堿基 | A(腺嘌呤) G(鳥(niǎo)嘌呤) C(胞嘧啶) T(胸腺嘧啶) | A(腺嘌呤) G(鳥(niǎo)嘌呤) C(胞嘧啶) U(尿嘧啶) |
分布 | 主要存在于細(xì)胞核,少量存在于線(xiàn)粒體和葉綠體 | 主要存在于細(xì)胞質(zhì) |
功能 | 攜帶遺傳信息,在生物體的遺傳、變異和蛋白質(zhì)的生物合成中具有極其重要的作用 | 作為遺傳物質(zhì):只在RNA病毒中;不作為遺傳物質(zhì):在DNA控制蛋白質(zhì)合成過(guò)程中起作用。mRNA是蛋白質(zhì)是合成的直接模板、tRNA能攜帶特定氨基酸、rRNA是核糖體的組成成分;催化作用:酶的一種 |
(1)五碳糖--DNA是脫氧核糖;RNA是核糖。
(2)堿基--DNA是A、T、C、G(不含U);RNA是A、U、C、G(不含T)。
(3)DNA通常是雙螺旋結(jié)構(gòu);RNA通常是單鏈,局部可形成雙螺旋結(jié)構(gòu)。
核酸在實(shí)踐應(yīng)用方面有極重要的作用,現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)近2000種遺傳性疾病都和DNA結(jié)構(gòu)有關(guān)。如人類(lèi)鐮刀形紅血細(xì)胞貧血癥是由于患者的血紅蛋白分子中一個(gè)氨基酸的遺傳密碼發(fā)生了改變,白化病患者則是DNA分子上缺乏產(chǎn)生促黑色素生成的酪氨酸酶的基因所致。腫瘤的發(fā)生、病毒的感染、射線(xiàn)對(duì)機(jī)體的作用等都與核酸有關(guān)。70年代以來(lái)興起的遺傳工程,使人們可用人工方法改組DNA,從而有可能創(chuàng)造出新型的生物品種。如應(yīng)用遺傳工程方法已能使大腸桿菌產(chǎn)生胰島素、干擾素等珍貴的生化藥物。
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從前面的描述我們也可以看得很清楚,核酸氧化分解后變成了磷酸和堿基的嘌呤和嘧啶,嘌呤也是導(dǎo)致人類(lèi)尿酸增高和痛風(fēng)的主要原因。
核酸氧化分解-生成嘌呤-嘌呤在肝臟進(jìn)一步氧化成為(2,6,8-三氧嘌呤)又稱(chēng)為尿酸,尿酸鹽沉積到關(guān)節(jié)腔等組織引起痛風(fēng)發(fā)作。
因此,核酸不是越多越好,同時(shí),這也說(shuō)明了為什么中老年易患痛風(fēng),因?yàn)槟昙o(jì)大了,大量的細(xì)胞死亡,而細(xì)胞內(nèi)有大量的核酸,生成嘌呤,再生成尿酸,從而導(dǎo)致痛風(fēng)發(fā)作。防治好痛風(fēng)就是要防止核酸被氧化。
①酸效應(yīng):在強(qiáng)酸和高溫,核酸完全水解為堿基,核糖或脫氧核糖和磷酸。在濃度略稀的的無(wú)機(jī)酸中,最易水解的化學(xué)鍵被選擇性的斷裂,一般為連接嘌呤和核糖的糖苷鍵,從而產(chǎn)生脫嘌呤核酸。
②堿效應(yīng)
1. DNA:當(dāng)PH值超出生理范圍(pH7~8)時(shí),對(duì)DNA結(jié)構(gòu)將產(chǎn)生更為微妙的影響。堿效應(yīng)使堿基的互變異構(gòu)態(tài)發(fā)生變化。這種變化影響到特定堿基間的氫鍵作用,結(jié)果導(dǎo)致DNA雙鏈的解離,稱(chēng)為DNA的變性
2.RNA:PH較高時(shí),同樣的變性發(fā)生在RNA的螺旋區(qū)域中,但通常被RNA的堿性水解所掩蓋。這是因?yàn)镽NA存在的2`-OH參與到對(duì)磷酸脂鍵中磷酸分子的分子內(nèi)攻擊,從而導(dǎo)致RNA的斷裂。
③化學(xué)變性:一些化學(xué)物質(zhì)能夠使DNA/RNA在中性PH下變性。由堆積的疏水堿基形成的核酸二級(jí)結(jié)構(gòu)在能量上的穩(wěn)定性被削弱,則核酸變性。
①黏性:DNA的高軸比等性質(zhì)使得其水溶液具有高黏性,很長(zhǎng)的DNA分子又易于被機(jī)械力或超聲波損傷,同時(shí)黏度下降。
② 浮力密度:可根據(jù)DNA的密度對(duì)其進(jìn)行純化和分析。在高濃度分子質(zhì)量的鹽溶液(CsCl)中,DNA具有與溶液大致相同的密度,將溶液高速離心,則CsCl趨于沉降于底部,從而建立密度梯度,而DNA最終沉降于其浮力密度相應(yīng)的位置,形成狹帶,這種技術(shù)成為平衡密度梯度離心或等密度梯度離心。
③穩(wěn)定性:核酸的結(jié)構(gòu)相當(dāng)穩(wěn)定,其主要原因有1、堿基對(duì)間的氫鍵2、堿基的堆積作用3、環(huán)境中的陽(yáng)離子。
①減色性:dsDNA相對(duì)于ssDNA是減色的,而ssDNA相對(duì)于dsDNA是增色的。
② DNA純度:A260/A280。
①熱變性:dsDNA與RNA的熱力學(xué)表現(xiàn)不同,隨著溫度的升高RNA中雙鏈部分的堿基堆積會(huì)逐漸地減少,其吸光性值也逐漸地,不規(guī)則地增大。較短的堿基配對(duì)區(qū)域具有更高的熱力學(xué)活性,因而與較長(zhǎng)的區(qū)域相比變性快。而dsDNA熱變性是一個(gè)協(xié)同過(guò)程。分子末端以及內(nèi)部更為活躍的富含A-T的區(qū)域的變性將會(huì)使其赴京的螺旋變得不穩(wěn)定,從而導(dǎo)致整個(gè)分子結(jié)構(gòu)在解鏈溫度下共同變性。
② 復(fù)性:DNA的熱變性可通過(guò)冷卻溶液的方法復(fù)原。不同核酸鏈之間的互補(bǔ)部分的復(fù)性稱(chēng)為雜交。
一般來(lái)說(shuō),進(jìn)化程度高的生物DNA分子應(yīng)越大,能貯存更多遺傳信息。但進(jìn)化的復(fù)雜程度與DNA大小并不完全一致,如哺乳類(lèi)動(dòng)物DNA約為3×10 bp,但有些兩棲類(lèi)動(dòng)物、南美肺魚(yú)DNA大小可達(dá)1010bp到1011bp。
常用測(cè)定DNA分子大小的方法有電泳法、離心法。凝膠電泳是當(dāng)前研究核酸的最常用方法,凝膠電泳有瓊脂糖(agarose)凝膠電泳和聚丙烯酰胺(polyacrylamide)凝膠電泳。
DNA和RNA中的糖苷鍵與磷酸酯鍵都能用化學(xué)法和酶法水解。在很低pH條件下DNA和RNA都會(huì)發(fā)生磷酸二酯鍵水解。并且堿基和核糖之間的糖苷鍵更易被水解,其中嘌呤堿的糖苷鍵比嘧啶堿的糖苷鍵對(duì)酸更不穩(wěn)定。在高pH時(shí),RNA的磷酸酯鍵易被水解,而DNA的磷酸酯鍵不易被水解。
水解核酸的酶有很多種,若按底物專(zhuān)一性分類(lèi),作用于RNA的稱(chēng)為核糖核酸酶(ribonuclease,RNase),作用于DNA的則稱(chēng)為脫氧核糖核酸酶(deoxyribonuclease,DNase)。按對(duì)底物作用方式分類(lèi),可分核酸內(nèi)切酶(endonuclease)與核酸外切酶(exonuclease)。核酸內(nèi)切酶的作用是在多核苷酸內(nèi)部的3',5'磷酸二酯鍵,有些內(nèi)切酶能識(shí)別DNA雙鏈上特異序列并水解有關(guān)的3',5'磷酸二酯鍵。核酸內(nèi)切酶是非常重要的工具酶,在基因工程中有廣泛用途。而核酸外切酶只對(duì)核酸末端的3',5'磷酸二酯鍵有作用,將核苷酸一個(gè)一個(gè)切下,可分為5'→3'外切酶,與3'→5'外切酶。
在一定理化因素作用下,核酸雙螺旋等空間結(jié)構(gòu)中堿基之間的氫鍵斷裂,變成單鏈的現(xiàn)象稱(chēng)為變性(denaturation)。引起核酸變性的常見(jiàn)理化因素有加熱、酸、堿、尿素和甲酰胺等。在變性過(guò)程中,核酸的空間構(gòu)象被破壞,理化性質(zhì)發(fā)生改變。由于雙螺旋分子內(nèi)部的堿基暴露,其A260值會(huì)大大增加。A260值的增加與解鏈程度有一定比例關(guān)系,這種關(guān)系稱(chēng)為增色效應(yīng)(hyperchromic effect)。如果緩慢加熱DNA溶液,并在不同溫度測(cè)定其A260值,可得到"S"形DNA熔化曲線(xiàn)(melting curve)。從DNA熔化曲線(xiàn)可見(jiàn)DNA變性作用是在一個(gè)相當(dāng)窄的溫度內(nèi)完成的。
當(dāng)A260值開(kāi)始上升前DNA是雙螺旋結(jié)構(gòu),在上升區(qū)域分子中的部分堿基對(duì)開(kāi)始斷裂,其數(shù)值隨溫度的升高而增加,在上部平坦的初始部分尚有少量堿基對(duì)使兩條鏈還結(jié)合在一起,這種狀態(tài)一直維持到臨界溫度,此時(shí)DNA分子最后一個(gè)堿基對(duì)斷開(kāi),兩條互補(bǔ)鏈徹底分離。通常把加熱變性時(shí)DNA溶液A260升高達(dá)到最大值一半時(shí)的溫度稱(chēng)為該DNA的熔解溫度(melting temperature Tm),Tm是研究核酸變性很有用的參數(shù)。Tm一般在85~95℃之間,Tm值與DNA分子中G C含量成正比。
變性DNA在適當(dāng)條件下,可使兩條分開(kāi)的單鏈重新形成雙螺旋DNA的過(guò)程稱(chēng)為復(fù)性(renaturation)。當(dāng)熱變性的DNA經(jīng)緩慢冷卻后復(fù)性稱(chēng)為退火(annealing)。DNA復(fù)性是非常復(fù)雜的過(guò)程,影響DNA復(fù)性速度的因素很多:DNA濃度高,復(fù)性快;DNA分子大復(fù)性慢;高溫會(huì)使DNA變性,而溫度過(guò)低可使誤配對(duì)不能分離等等。最佳的復(fù)性溫度為T(mén)m減去25℃,一般在60℃左右。離子強(qiáng)度一般在0.4mol/L以上。
具有互補(bǔ)序列的不同來(lái)源的單鏈核酸分子,按堿基配對(duì)原則結(jié)合在一起稱(chēng)為雜交(hybridization)。雜交可發(fā)生在DNA-DNA、RNA-RNA和DNA-RNA之間。雜交是分子生物學(xué)研究中常用的技術(shù)之一,利用它可以分析基因組織的結(jié)構(gòu),定位和基因表達(dá)等,常用的雜交方法有Southern印跡法,Northern印跡法和原位雜交(insitu hybridization)等。
核酸、蛋白質(zhì)誰(shuí)更"牛"?
一般人都知道,生命是蛋白質(zhì)存在的形式,蛋白質(zhì)是生命的基礎(chǔ)。在發(fā)現(xiàn)核酸前,這句話(huà)是對(duì)的,但當(dāng)核酸被發(fā)現(xiàn)后,應(yīng)該說(shuō)最本質(zhì)的生命物質(zhì)是核酸,或是把上述的這句話(huà)更正為蛋白體是生命的基礎(chǔ)。按照現(xiàn)代生物學(xué)的觀(guān)點(diǎn),蛋白體是包括核酸和蛋白質(zhì)的生物大分子。
核酸在生命中為什么比蛋白質(zhì)更重要呢?因?yàn)樯闹匾允悄茏晕覐?fù)制,而核酸就能夠自我復(fù)制。蛋白質(zhì)的復(fù)制是根據(jù)核酸所發(fā)出的指令,使氨基酸根據(jù)其指定的種類(lèi)進(jìn)行合成,然后再按指定的順序排列成所需要復(fù)制的蛋白質(zhì)。世界上各種有生命的物質(zhì)都含有蛋白體,蛋 白體中有核酸和蛋白質(zhì),至今還沒(méi)有發(fā)現(xiàn)有蛋白質(zhì)而沒(méi)有核酸的生命。但在有生命的病毒研究中,卻發(fā)現(xiàn)病毒以核酸為主體,蛋白質(zhì)和脂肪以及脂蛋白等只不過(guò)充作其外殼,作為與外界環(huán)境的界限而已,當(dāng)它鉆入寄生細(xì)胞繁殖子代時(shí),把外殼留在細(xì)胞外,只有核酸進(jìn)入細(xì)胞內(nèi) ,并使細(xì)胞在核酸控制下為其合成子代的病毒。這種現(xiàn)象,美國(guó)科學(xué)家比喻為人和汽車(chē)的關(guān)系。即把核酸比為人,蛋白質(zhì)比作汽車(chē),人駕駛汽車(chē)到處跑,外表上看,人車(chē)一體是有生命運(yùn)動(dòng)的東西,而真正的生命是人,汽車(chē)只是由人制造的載入的外殼。有一種類(lèi)病毒,是能繁殖子代的有生命物體,其中只有核酸而沒(méi)蛋白質(zhì),可見(jiàn)核酸是真正的生命物質(zhì)。
因此中國(guó)1996年最新出版的《人體生理學(xué)》改變了舊教科書(shū)中只提蛋白質(zhì)是生命基礎(chǔ)的缺陷,明確提出:"蛋白質(zhì)和核酸是一切生命活動(dòng)的物質(zhì)基礎(chǔ)。"
然而,多少年來(lái),人們?cè)谝晃蹲非蟮鞍踪|(zhì)、維生素、微量元素等營(yíng)養(yǎng)時(shí),卻把最重要的角色--核酸忘卻了,這不能不說(shuō)是人類(lèi)生命史上的一大遺憾。
沒(méi)有核酸,就沒(méi)有蛋白,也就沒(méi)有生命。
核酸也稱(chēng)多聚核苷酸,是由許多個(gè)核苷酸聚合而成的生物大分子,核苷酸是由含氮的堿基、核糖或脫氧核糖、磷酸三種分子連接而成。堿基與糖通過(guò)糖苷鍵連接成核苷,核苷與磷酸以酯鍵連接成核苷酸。核苷酸是生物體內(nèi)一類(lèi)重要含氮化合物,是各種核酸的基本組成單位。根據(jù)核酸所含戊糖的不同,可分為核糖核酸(RNA)和脫氧核糖核酸(DNA)二種。
核酸不但是一切生物細(xì)胞的基本成分,還對(duì)生物體的生長(zhǎng)、發(fā)育、繁殖、遺傳及變異等重大生命現(xiàn)象起主宰作用。它在生物科學(xué)的地位,可用"沒(méi)有核酸就沒(méi)有生命"這句話(huà)來(lái)概括。
飲食核酸的營(yíng)養(yǎng)保健作用如下:
1.飲食核酸與免疫 '
從核酸對(duì)機(jī)體各系統(tǒng)的影響來(lái)看,免疫系統(tǒng)是最敏感也是最直接受影響的系統(tǒng)。1985年科學(xué)家就證實(shí)無(wú)核酸飲食或低核酸飲食配方飼喂的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物,其細(xì)胞免疫功能低下,條件致病菌就可使其感染。無(wú)核酸飲食致使T淋巴細(xì)胞發(fā)育障礙、功能低下,而沒(méi)有細(xì)胞免疫反應(yīng)的發(fā)生,同時(shí)影響T細(xì)胞依賴(lài)的體液免疫的產(chǎn)生;補(bǔ)充核酸營(yíng)養(yǎng)后可恢復(fù)免疫系統(tǒng)的發(fā)育和免疫功能。實(shí)驗(yàn)表明,核酸是維持機(jī)體正常免疫功能和免疫系統(tǒng)生長(zhǎng)代謝的必需營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)。
2.飲食核酸與衰老和內(nèi)分泌
衰老是機(jī)體各組織器官的退行性變化,關(guān)于衰老發(fā)生機(jī)制的學(xué)說(shuō)很多,如自由基學(xué)說(shuō)、免疫學(xué)說(shuō)、內(nèi)分泌學(xué)說(shuō)、遺傳學(xué)說(shuō)等。脂質(zhì)過(guò)氧化隨年齡增大而增高,并伴有酶與非酶系統(tǒng)防御功能下降,導(dǎo)致體內(nèi)自由基濃度升高。代謝性、退行性疾病的發(fā)生和發(fā)展與體內(nèi)過(guò)氧化脂質(zhì)含量高度正相關(guān)。飲食核酸能增加血漿單不飽和脂肪酸和co-3、¨6系列多不飽和脂肪酸的含量,多不飽和脂肪酸的增加可提高機(jī)體對(duì)抗自由基的能力。飲食核酸作為使遺傳物質(zhì)活潑代謝的原料,具有極強(qiáng)的抗生物氧化、消除體內(nèi)自由基和全面增強(qiáng)免疫功能及性激素分泌的作用,因此在延緩衰老方面優(yōu)勢(shì)顯著。
3.飲食核酸與增殖細(xì)胞
飲食中補(bǔ)加核酸有助于肝臟再生和受損傷的小腸恢復(fù)功能。有無(wú)核酸飲食對(duì)比研究證明,一段時(shí)期內(nèi)膳食中如缺乏核酸,將對(duì)大鼠肝臟的超微結(jié)構(gòu)及功能造成不良影響,提示飲食核酸是維持肝臟處于正常生理狀態(tài)的必需營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)。血液中的紅細(xì)胞、白細(xì)胞、血小板和血漿蛋白等也都是代謝較快的增殖細(xì)胞系,加之它們中的大多數(shù)均無(wú)從頭合成核酸的能力,因此它們的代謝和功能也都需要充足的核酸營(yíng)養(yǎng)。再生障礙性貧血和抗癌藥物、放療、化療等引起的貧血,即缺鐵性貧血之外的貧血均需補(bǔ)充核酸營(yíng)養(yǎng),以改善骨髓造血功能和血液成分的代謝活力。
4.飲食核酸與癌癥
人體每日約有數(shù)百萬(wàn)個(gè)癌狀細(xì)胞出現(xiàn),它們幾乎全部被機(jī)體的免疫監(jiān)視系統(tǒng)和核酸、維生素等食物成分,在形成大的癌細(xì)胞克隆前排除掉。因此在日常生活中盡量避免致癌因子的作用,增加核酸等防癌因素的作用非常必要。
5.飲食核酸與癡呆等神經(jīng)障礙
食物核酸提取物對(duì)癡呆癥狀的改善非常令人鼓舞。在大鼠實(shí)驗(yàn)中,如給大鼠腦注射RNA合成阻斷劑,則所掌握的學(xué)習(xí)能力和記憶能力在5小時(shí)后喪失,但如在注射RNA合成阻斷劑的同時(shí)注射拮抗阻斷劑的物質(zhì),這種記憶喪失就不發(fā)生。美國(guó)哈佛大學(xué)的研究也表明,老年癡呆患者腦內(nèi)神經(jīng)纖維變化多的部位,RNA和蛋白質(zhì)合成顯著減少,因此發(fā)生記憶障礙。
6.飲食核酸與循環(huán)系統(tǒng)
核酸營(yíng)養(yǎng)對(duì)循環(huán)系統(tǒng)的作用是抑制過(guò)氧化脂質(zhì)的形成,抑制膽固醇的生成,擴(kuò)張血管,改善血流,糾正心肌代償不良,促進(jìn)血管壁再生,抑制血小板凝集i因此核酸被認(rèn)為對(duì)腦血栓、心肌梗死、高血壓和動(dòng)脈粥樣硬化癥有較好的營(yíng)養(yǎng)保健作用。
7、飲食核酸與糖尿病
非胰島素依賴(lài)性糖尿病與生活方式和運(yùn)動(dòng)不足關(guān)系密切,如果在普通的飲食療法的基礎(chǔ)上,再加上核酸飲食,將收到更好的效果。其原因:一是糖尿病患者血清中過(guò)氧化脂質(zhì)增多,核酸及其代謝產(chǎn)物對(duì)其具有較強(qiáng)的清除作用;二是由于核酸的促細(xì)胞(包括促胰臟的胰島素分泌細(xì)胞)代謝功能。除此之外,核酸的代謝產(chǎn)物腺苷還有抑制糖的分解作用,使糖在小腸內(nèi)的吸收減緩。
除上述作用外,飲食核酸還有以下作用:減肥,提高機(jī)體對(duì)環(huán)境變化的耐受力,顯著的抗疲勞、增強(qiáng)機(jī)體對(duì)冷熱的抵抗力、促進(jìn)攝人氧氣的利用,促進(jìn)小鼠生殖系統(tǒng)的發(fā)育等。
對(duì)于嬰兒、迅速成長(zhǎng)期的孩子、老年體弱多病、全身感染、外傷手術(shù)者、肝功能不全以及白細(xì)胞、T細(xì)胞、淋巴細(xì)胞降低人群等,可以額外補(bǔ)充核酸類(lèi)物質(zhì)。世界衛(wèi)生組織規(guī)定,每天膳食中核酸的量不大于2克,扣除食物中的核酸攝入量,每天補(bǔ)充小于1.5克核酸是合適的。
人工核酸治療白血病
日本工業(yè)技術(shù)院產(chǎn)業(yè)技術(shù)融合領(lǐng)域研究所已開(kāi)發(fā)出了治療白血病的人造核酸。這種人造核酸就像一把剪刀,可發(fā)現(xiàn)引起白血病的遺傳基因并將其剪除??蒲行〗M的成員、東京大學(xué)研究生院教授多比良和誠(chéng)根據(jù)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)結(jié)果認(rèn)為,這種人造核酸將來(lái)有望成為治療白血病的主要藥物。
這次研究的對(duì)象是慢性骨髓性白血病(MCL),患者的異常遺傳因子是由兩個(gè)正常的遺傳因子連接而成的,新開(kāi)發(fā)的人造核酸可以發(fā)現(xiàn)這種變異遺傳基因并將其切斷??茖W(xué)家過(guò)去也發(fā)現(xiàn)過(guò)能找到特定的遺傳因子序列并將其切斷的分子,但在切斷特定遺傳因子序列的同時(shí)往往對(duì)正常細(xì)胞造成傷害。而新開(kāi)發(fā)出的核酸只在發(fā)現(xiàn)異常遺傳因子時(shí)才被激活,平時(shí)則潛伏不動(dòng)。
科研小組用人體白血病細(xì)胞進(jìn)行了動(dòng)物實(shí)驗(yàn)。他們將可與人造核酸反應(yīng)的細(xì)胞和不可與人造核酸反應(yīng)的細(xì)胞分別注射到8只實(shí)驗(yàn)鼠的體內(nèi)。移植后第13周時(shí),不與人造核酸反應(yīng)的細(xì)胞全部死亡,而與人造核酸反應(yīng)的細(xì)胞全部存活,證明人造核酸在生物體內(nèi)十分有效。
科研小組說(shuō),此人造核酸的臨床應(yīng)用尚有諸多問(wèn)題要解決,將來(lái)很可能是把患者的骨髓細(xì)胞抽出來(lái),經(jīng)人造核酸處理后,再把正常細(xì)胞的骨髓輸回患者體內(nèi)。
核酸的生物功能
核酸在生物體內(nèi)主要與蛋白質(zhì)合成核蛋白存在,它既是蛋白質(zhì)生物合成不可缺少的物質(zhì),又是生物遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)。
DNA主要存在于細(xì)胞核中,它們是遺傳信息的攜帶者,DNA的結(jié)構(gòu)決定生物合成蛋白質(zhì)的特定結(jié)構(gòu),并保證這種遺傳特性傳給下一代。RNA主要存在于細(xì)胞質(zhì)中,它們是以DNA為模板而形成的,并且直接參加蛋白質(zhì)的生物合成過(guò)程。因此,DNA是RNA的模板,而RNA又是蛋白質(zhì)的模板。存在于DNA分子上的遺傳信息就是這樣由DNA傳遞給RNA,再傳遞給蛋白質(zhì)。通過(guò)DNA 復(fù)制,遺傳信息一代代傳下去,正因?yàn)橛羞@樣的功能,人們把核酸譽(yù)為"生命之源"和"生命之本"。
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施工組織設(shè)計(jì)方案 第一章 編制說(shuō)明 1. 綜合說(shuō)明 1.1. 本工程投標(biāo)施工組織設(shè)計(jì),是我方結(jié)合工程設(shè)計(jì)圖紙,在充分 理解招標(biāo)文件的基礎(chǔ)上編制的,是我公司為優(yōu)質(zhì)、高效、安全、 低耗地完成該工程任務(wù)即作出慎重承諾。 1.2. 本施工組織設(shè)計(jì)是投標(biāo)階段編制的,未經(jīng)建設(shè)、設(shè)計(jì)、監(jiān)理等 有關(guān)專(zhuān)家審查,若我公司有幸能中標(biāo),我們將在認(rèn)真聽(tīng)取相關(guān)專(zhuān) 家的寶貴意見(jiàn)的基礎(chǔ)上,對(duì)本施工組織設(shè)計(jì)進(jìn)一步修改完善,編 制更為切合實(shí)際的實(shí)施性施工組織設(shè)計(jì)。 1.3. 若有幸中標(biāo),我們將充分發(fā)揮國(guó)有大型建筑企業(yè)的優(yōu)勢(shì)和成熟 的機(jī)電安裝施工工藝,科學(xué)組織交叉流水作業(yè),精心施工,嚴(yán)格 履行合同,嚴(yán)格按照規(guī)范化的質(zhì)量體系文件進(jìn)行操作,以“科學(xué)、 經(jīng)濟(jì)、高效”的原則編制詳細(xì)的施工組織設(shè)計(jì)用于指導(dǎo)施工,加 強(qiáng)項(xiàng)目管理,提高工程質(zhì)量,從而將本工程建成一流工程。 2. 編制依據(jù) 2.1. 本投標(biāo)施工方案遵照招標(biāo)文件中的各項(xiàng)條款要求進(jìn)
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04呂建新-核酸分子標(biāo)志物檢測(cè)
核酸的定量是分光光度計(jì)使用頻率最高的功能。可以定量溶于緩沖液的寡核苷酸,單鏈、雙鏈DNA,以及RNA。核酸的最高吸收峰的吸收波長(zhǎng)260 nm。每種核酸的分子構(gòu)成不一,因此其換算系數(shù)不同。定量不同類(lèi)型的核酸,事先要選擇對(duì)應(yīng)的系數(shù)。如:1OD 的吸光值分別相當(dāng)于50μg/ml的dsDNA,37μg/ml的ssDNA,40μg/ml的RNA,30μg/ml的Olig。測(cè)試后的吸光值經(jīng)過(guò)上述系數(shù)的換算,從而得出相應(yīng)的樣品濃度。測(cè)試前,選擇正確的程序,輸入原液和稀釋液的體積,爾后測(cè)試空白液和樣品液。然而,實(shí)驗(yàn)并非一帆風(fēng)順。讀數(shù)不穩(wěn)定可能是實(shí)驗(yàn)者最頭痛的問(wèn)題。靈敏度越高的儀器,表現(xiàn)出的吸光值漂移越大。
事實(shí)上,分光光度計(jì)的設(shè)計(jì)原理和工作原理,允許吸光值在一定范圍內(nèi)變化,即儀器有一定的準(zhǔn)確度和精確度。如Eppendorf Biophotometer的準(zhǔn)確度≤1.0%(1A)。這樣多次測(cè)試的結(jié)果在均值1.0%左右之間變動(dòng),都是正常的。另外,還需考慮核酸本身物化性質(zhì)和溶解核酸的緩沖液的pH值,離子濃度等:在測(cè)試時(shí),離子濃度太高,也會(huì)導(dǎo)致讀數(shù)漂移,因此建議使用pH值一定、離子濃度較低的緩沖液,如TE,可大大穩(wěn)定讀數(shù)。樣品的稀釋濃度同樣是不可忽視的因素:由于樣品中不可避免存在一些細(xì)小的顆粒,尤其是核酸樣品。這些小顆粒的存在干擾測(cè)試效果。為了最大程度減少顆粒對(duì)測(cè)試結(jié)果的影響,要求核酸吸光值至少大于0.1A,吸光值最好在0.1-1.5A。在此范圍內(nèi),顆粒的干擾相對(duì)較小,結(jié)果穩(wěn)定。從而意味著樣品的濃度不能過(guò)低,或者過(guò)高(超過(guò)光度計(jì)的測(cè)試范圍)。最后是操作因素,如混合要充分,否則吸光值太低,甚至出現(xiàn)負(fù)值;混合液不能存在氣泡,空白液無(wú)懸浮物,否則讀數(shù)漂移劇烈;必須使用相同的比色杯測(cè)試空白液和樣品,否則濃度差異太大;換算系數(shù)和樣品濃度單位選擇一致
除了核酸濃度,分光光度計(jì)同時(shí)顯示幾個(gè)非常重要的比值表示樣品的純度,如A260/A280的比值,用于評(píng)估樣品的純度,因?yàn)榈鞍椎奈辗迨?80nm。純凈的樣品,比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8 或者2.0,表示存在蛋白質(zhì)或者酚類(lèi)物質(zhì)的影響。A230表示樣品中存在一些污染物,如碳水化合物,多肽,苯酚等,較純凈的核酸A260/A230的比值大于2.0。A320檢測(cè)溶液的混濁度和其他干擾因子。
利用一般生化專(zhuān)用的96孔反應(yīng)盤(pán),可同時(shí)操作1-32個(gè)樣品,可廣泛應(yīng)用于常規(guī)科研、基因組學(xué)、疾控系統(tǒng)、食品安全、法醫(yī)等領(lǐng)域。使用本儀器只需加入樣品與以磁珠為載體的全自動(dòng)核酸提取試劑于96孔專(zhuān)用反應(yīng)盤(pán)中,選擇或編輯適當(dāng)程序后執(zhí)行即可。搭配不同種類(lèi)的磁珠核酸試劑組,可以快速提取動(dòng)植物組織、血液、體液、刑事檢體等樣品中的DNA和RNA。
核酸的定量是分光光度計(jì)使用頻率最高的功能??梢远咳苡诰彌_液的寡核苷酸,單鏈、雙鏈DNA,以及RNA。核酸的最高吸收峰的吸收波長(zhǎng)260 nm。每種核酸的分子構(gòu)成不一,因此其換算系數(shù)不同。定量不同類(lèi)型的核酸,事先要選擇對(duì)應(yīng)的系數(shù)。如:1OD 的吸光值分別相當(dāng)于50μg/ml的dsDNA,37μg/ml的ssDNA,40μg/ml的RNA,30μg/ml的Olig。測(cè)試后的吸光值經(jīng)過(guò)上述系數(shù)的換算,從而得出相應(yīng)的樣品濃度。測(cè)試前,選擇正確的程序,輸入原液和稀釋液的體積,爾后測(cè)試空白液和樣品液。然而,實(shí)驗(yàn)并非一帆風(fēng)順。讀數(shù)不穩(wěn)定可能是實(shí)驗(yàn)者最頭痛的問(wèn)題。靈敏度越高的儀器,表現(xiàn)出的吸光值漂移越大。
事實(shí)上,分光光度計(jì)的設(shè)計(jì)原理和工作原理,允許吸光值在一定范圍內(nèi)變化,即儀器有一定的準(zhǔn)確度和精確度。如Eppendorf Biophotometer的準(zhǔn)確度≤1.0%(1A)。這樣多次測(cè)試的結(jié)果在均值1.0%左右之間變動(dòng),都是正常的。另外,還需考慮核酸本身物化性質(zhì)和溶解核酸的緩沖液的pH值,離子濃度等:在測(cè)試時(shí),離子濃度太高,也會(huì)導(dǎo)致讀數(shù)漂移,因此建議使用pH值一定、離子濃度較低的緩沖液,如TE,可大大穩(wěn)定讀數(shù)。樣品的稀釋濃度同樣是不可忽視的因素:由于樣品中不可避免存在一些細(xì)小的顆粒,尤其是核酸樣品。這些小顆粒的存在干擾測(cè)試效果。為了最大程度減少顆粒對(duì)測(cè)試結(jié)果的影響,要求核酸吸光值至少大于0.1A,吸光值最好在0.1-1.5A。在此范圍內(nèi),顆粒的干擾相對(duì)較小,結(jié)果穩(wěn)定。從而意味著樣品的濃度不能過(guò)低,或者過(guò)高(超過(guò)光度計(jì)的測(cè)試范圍)。最后是操作因素,如混合要充分,否則吸光值太低,甚至出現(xiàn)負(fù)值;混合液不能存在氣泡,空白液無(wú)懸浮物,否則讀數(shù)漂移劇烈;必須使用相同的比色杯測(cè)試空白液和樣品,否則濃度差異太大;換算系數(shù)和樣品濃度單位選擇一致;不能采用窗口磨損的比色杯;樣品的體積必須達(dá)到比色杯要求的最小體積等多個(gè)操作事項(xiàng)。
除了核酸濃度,分光光度計(jì)同時(shí)顯示幾個(gè)非常重要的比值表示樣品的純度,如A260/A280的比值,用于評(píng)估樣品的純度,因?yàn)榈鞍椎奈辗迨?80nm。純凈的樣品,比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8 或者2.0,表示存在蛋白質(zhì)或者酚類(lèi)物質(zhì)的影響。A230表示樣品中存在一些污染物,如碳水化合物,多肽,苯酚等,較純凈的核酸A260/A230的比值大于2.0。A320檢測(cè)溶液的混濁度和其他干擾因子。純樣品,A320一般是0。